עם עלייתם ארצה של חלק מהורי חברי המשק, התעורר הצורך להקמת מטבח כשר ובית כנסת עבור ההורים שומרי המצוות. בית הכנסת הראשון ומטבח ההורים הוקמו ב- 1935 בין הצריפים שבשיפולי הגבעה המערביים (במקום שהיום הבית של רינה בן נחשון). בשנת 1964 עבר לבית הסוכנות י'. (בית הכנסת היום)
לאורך השנה התקשו פרנסי המקום למצוא 'מניין', אך בראש השנה ויום כיפור התמלא בית הכנסת בחברים וילדים שבאו להאזין לתקיעת השופר. בין ה'תוקעים' המהוללים היה סבא צמח שגם אחרי גיל 80 ו- 90 ניפח את ריאותיו ותקע בשופר לקול מצהלות הילדים. לבית הכנסת הייתה תרומה חשובה בשילוב המסורת וה'יידישקייט' בחיי התרבות של גבעת ברנר. שנים רבות דאג לטיפוח המקום הח' שולם גדון ש'חזר בתשובה' ואחריו הח' יונתן קיטאי. בשנת 2007, לאחר שנים ארוכות, עבר בית כנסת למקומו החדש סמוך לבית ישע. באפריל 2009 הוכנס לבית הכנסת ספר תורה שנתרם לזכר הנופלים במערכות ישראל.
